据新疆自治区植物保护站分析预测，预计2008年新疆棉花病虫害仍将偏重发生。
　　预计2008年，棉花病虫害总体偏重局部中度发生，虫害重于病害。棉蚜仍然偏重发生，棉叶螨回升明显，棉蓟马、棉盲蝽等次要害虫上升危害，棉铃虫南疆发生程度有所下降、北疆则上升危害。烟粉虱近几年开始在吐鲁番棉田大发生，预计2008年仍将偏重发生。棉田自然生态环境的好转对棉花病害发生起到了抑制作用，苗期病害和棉花枯黄痿病偏轻发生。棉花病虫害发生面积2000万亩次左右。其中：棉花虫害发生面积1800万亩次左右，病害发生面积200万亩左右。
　　棉蚜：苗蚜预计在全疆范围内中度发生（3级），发生面积134万亩次。伏蚜中度偏重发生（4级）、乌苏市大发生（5级），发生面积315万亩次左右。东疆、南疆迁入棉田始见期为4月下旬至5月初，北疆为5月中旬。
　　棉铃虫预计在全疆大部棉区中度发生（3级），北疆乌苏市、沙湾县中度偏重发生（4级）。全疆发生面积445万亩次。其中一代在麦田、加工番茄田中度偏轻发生（2级），发生面积175万亩；二代南疆、东疆中度发生（3级），北疆局部棉田中度偏重发生（4级），发生面积260万亩；三代中度发生（3级），发生面积210 万亩。
　　棉叶螨预计在全疆大部棉区中度偏重发生（4级），阿瓦提县、乌苏市大发生（5级），全疆发生面积330万亩次。 棉蓟马预计南疆中度偏重发生（4级），北疆中度发生（3级），发生面积350万亩次。棉盲蝽象预计阿克苏地区中度偏重发生（4级），其他地区中度发生，发生面积45万亩次。烟粉虱在吐鲁番地区预计中度偏重发生（4级），棉田发生面积15万亩次左右，发生高峰在8月中旬-9月中旬。
　　棉花枯黄萎病中度偏轻发生（2级），发生面积65万亩。棉花苗期病害北疆中度（3级）、南疆中度偏轻发生（2级），发生面积120万亩。